由于干細胞具有多向分化性，所以有體細胞補充以及組織修復重建的作用。填充干細胞可以應用在美容方面，將干細胞注射在皮膚中，可以促進皮膚修復。

填充干細胞對于痘坑、痘痕、斑點，以及毛孔粗大、凹陷性疤痕等，都有良好的治療效果。對于組織損傷導致的神經、血管、肌肉、脂肪組織等損傷，都可以注入各種類型的干細胞，促進局部組織進行自我修復，從而使組織恢復至正常狀態。這類干細胞一般是從自身血液，或脂肪細胞中提取獲得，只是從體細胞中進行原代提取，并沒有進行體外培養，所以相對比較安全。

雖然干細胞有多元分化的潛力，但也可能誘發腫瘤、癌癥的發生，所以一定要選擇正規的醫療機構，進行干細胞填充。在正規的醫療機構進行填充干細胞時，并不是直接注射干細胞，而是利用自身的脂肪、血清，與可能含有豐富干細胞的組織和結構混合后，再進行填充。